215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0130 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0130  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
174 aa  350  5.9999999999999994e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1778  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.98 
 
 
173 aa  204  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0880  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.71 
 
 
176 aa  187  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1737  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.39 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.65 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1178  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.02 
 
 
170 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.341742  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1009  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.02 
 
 
170 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000622248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
188 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.06 
 
 
189 aa  127  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0509  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.05 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.72 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.03 
 
 
187 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  44.24 
 
 
336 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  43.27 
 
 
190 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  44.24 
 
 
336 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  44.24 
 
 
336 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  44.24 
 
 
336 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  44.24 
 
 
336 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  42.42 
 
 
335 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.38 
 
 
192 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.76 
 
 
190 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.75 
 
 
183 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.79 
 
 
189 aa  120  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.17 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.99 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.37 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.17 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.75 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.79 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.72 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.57 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.52 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.12 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.57 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.72 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.35 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.75 
 
 
190 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  41.28 
 
 
190 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.75 
 
 
190 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.36 
 
 
190 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.75 
 
 
191 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.75 
 
 
191 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.75 
 
 
187 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.75 
 
 
190 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.75 
 
 
191 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.74 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.74 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.36 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.41 
 
 
183 aa  117  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2492  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.65 
 
 
187 aa  117  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.12 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0098  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.66 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.552457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.12 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  40.48 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.37 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.77 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.64 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.6 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.89 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.61 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.13 
 
 
192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.21 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.37 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1162  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.63 
 
 
188 aa  115  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  40.12 
 
 
185 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.51 
 
 
183 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.29 
 
 
196 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.13 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.72 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.12 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.59 
 
 
192 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  38.41 
 
 
171 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.51 
 
 
183 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.35 
 
 
182 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  38.95 
 
 
190 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.29 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.39 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.51 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.48 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  38.51 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.51 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.86 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.37 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.42 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.29 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.52 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  41.61 
 
 
192 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.95 
 
 
185 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.29 
 
 
191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.27 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.66 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.24 
 
 
192 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.48 
 
 
184 aa  111  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.32 
 
 
190 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.31 
 
 
195 aa  111  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  39.05 
 
 
190 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  42.44 
 
 
192 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  37.5 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>