169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3764 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  86.79 
 
 		 159 aa  266  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  81.13 
 
 		 159 aa  228  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  74.84 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  57.24 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  52.41 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  39.86 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  40.15 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  42.42 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  44 
 
 		 137 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  84.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  35.66 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.64 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  37.86 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.62 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.62 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  37.6 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  41.18 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  31.94 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  37.23 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  33.79 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  37.32 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.09 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  38.18 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.6 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  37.32 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  35.92 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  37.16 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  36.17 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  35.37 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  35.46 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  35.82 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.39 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  34.62 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  31.01 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  36.88 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.07 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.09 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  39.29 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.07 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  35.21 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  38.38 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  32.12 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  36.36 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  34.11 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  35.51 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  35.92 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  33.57 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.17 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  31.94 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.17 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  33.57 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  35.04 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  37.27 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  31.08 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  29.82 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  35.09 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  34.55 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  34.55 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  32.97 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.5 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  34.92 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  30.89 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  38.4 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  32.52 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  32.46 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  32.52 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  35.56 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  29.5 
 
 		 335 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  34.55 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  33.91 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  35.2 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  34.69 
 
 		 333 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  31.75 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  35.53 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  35.53 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  40 
 
 		 133 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  31.75 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  32.86 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  35.56 
 
 		 134 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  38 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>