164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1827 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  74.21 
 
 		 159 aa  220  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  74.84 
 
 		 159 aa  207  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  76.73 
 
 		 159 aa  207  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  52.74 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  52.38 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  35.21 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  38.41 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  31.78 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  30.15 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.57 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.96 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.88 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  35.71 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  30.95 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.15 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.11 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  37.5 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  37.88 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.6 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  37.14 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  34.88 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  33.57 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  34.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  34.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.69 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.69 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  34.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  34.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  34.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  34.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  32.86 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  36.45 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  36 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  36.51 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  35 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.07 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.53 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  36.43 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  31.21 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  33.08 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  31.45 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  32.61 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  38.16 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  38.16 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  33.57 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  29.73 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  31.69 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  32.59 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  32.59 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  32.59 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  34.04 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  28.15 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  34.75 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  34.29 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  32.59 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  32.61 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  34.11 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  31.85 
 
 		 336 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  33.64 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  30.37 
 
 		 335 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  32.56 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  32.56 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  33.65 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  31.54 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  30.34 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  38.21 
 
 		 133 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  33.81 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  32.28 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.67 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  31.54 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  31.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  32.32 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  36.61 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  29.93 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  33.87 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  31.43 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>