199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1179 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  51.22 
 
 		 167 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  46.27 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  43.61 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.21 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  46.34 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  35.77 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  41.98 
 
 		 335 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  41.22 
 
 		 336 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  41.22 
 
 		 336 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  41.22 
 
 		 336 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  41.22 
 
 		 336 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  40.3 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  40.3 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  44.44 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  39.5 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  39.55 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  38.24 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  40.46 
 
 		 336 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  43.09 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  41.35 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  41.67 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  41.35 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  41.18 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  45.13 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  40.94 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  42.4 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  37.14 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  42.73 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  46.85 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.28 
 
 		 333 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  41.86 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.82 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.1 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  38.35 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  47.52 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  40.4 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  39.5 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  37.78 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  37.78 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  41.35 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  37.98 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  39.68 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  40.48 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  34.33 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  43.12 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  43.12 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  43.12 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  37.96 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  40.48 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  38.68 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  32.33 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.59 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  37.86 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  36.5 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.51 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.89 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  32.35 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  41.57 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  39.37 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  33.09 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  33.09 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  33.82 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  37.21 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  35.4 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.3 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  40.16 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  40.82 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  31.91 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30.95 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  34.68 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  28.15 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  44.55 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  44.55 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  38.58 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  36.84 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.61 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  34.78 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  39.37 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.3 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  30.53 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  33.86 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  38.39 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  38.14 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  38.14 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  29.23 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>