138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1930 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1930  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 144 aa  277  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  41.01 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  37.72 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  37.72 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  37.72 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  34.21 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.4 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.4 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.19 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  31.2 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  37.86 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  34.75 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  38.46 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.45 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  35.45 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  35.2 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  31.3 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  38.68 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  32.2 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1374  hypothetical protein  34.95 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  35.29 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  32.2 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  41.41 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  35 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  37.96 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30.84 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  32.26 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  35.85 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  35.35 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  35.35 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  30.3 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  34.91 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  33.91 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  35.51 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  35.85 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  35.85 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  32.81 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  28.7 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  28.85 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  31.73 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  34.58 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  34.34 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.44 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.44 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  31.45 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  34.58 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  34.58 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  34.58 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  40.66 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  37.25 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  34.11 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  39.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  37.25 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  40.66 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  32.81 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  34.88 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  33.05 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  33.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  31.36 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  32.04 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  32.04 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  32.79 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  36.28 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  37.38 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  31.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  32.32 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  39.33 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  31.13 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  32.04 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  32.58 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  29.01 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  27.27 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>