177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4061 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  273  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  88.41 
 
 
143 aa  237  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  46.83 
 
 
144 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  46.46 
 
 
134 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  45.24 
 
 
144 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  45.97 
 
 
144 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  45.97 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  45.97 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  51.43 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  47.11 
 
 
133 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  47.62 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  53.73 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  48.06 
 
 
181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  53.78 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  46.27 
 
 
149 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  44.17 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  47.76 
 
 
149 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  47.76 
 
 
149 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  47.76 
 
 
149 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  47.76 
 
 
149 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  47.76 
 
 
149 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  47.76 
 
 
149 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  46.46 
 
 
133 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  56.44 
 
 
147 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  56.44 
 
 
147 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  56.44 
 
 
147 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  46.88 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  44.88 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  43.31 
 
 
135 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  41.46 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  44.7 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  43.51 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  39.69 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  36.15 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  46.94 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  38.46 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  33.83 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  39.1 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  30.3 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  38.6 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  40.77 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  35.66 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.35 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  38.64 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  38.64 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.09 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.51 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  37.5 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  34.34 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  41.41 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  37.88 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  39.1 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  39.1 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.47 
 
 
333 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.64 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.74 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  36.19 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  34.21 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  40.5 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  41.09 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.57 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.1 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  37.86 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  36.29 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  36.13 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  35.16 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  36.73 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  38.35 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  36.57 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  38.66 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  38.66 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  38.66 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  38.66 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  38.66 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  38.66 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  38.66 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.26 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  41.04 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  33.05 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  38.64 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.12 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  37.12 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  34.48 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  34.82 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  36.43 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  34.59 
 
 
178 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  34.59 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  35.29 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  39.47 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  39.47 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  41.05 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1374  hypothetical protein  34.65 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  32 
 
 
134 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  35.11 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  32 
 
 
134 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>