69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3443 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3443  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  300  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  40.28 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  56 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.32 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  49.4 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  32.9 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  37.93 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  29.33 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  35.9 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  34.44 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  33.1 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30.67 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  30.57 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  32.21 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  31.41 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  29.87 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  28.66 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.77 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  37.24 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  30.3 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  29.25 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  29.22 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  31.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  31.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  31.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  34.35 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.76 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  30.52 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  28.1 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  30.13 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  27.92 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  31.41 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  27.33 
 
 		 132 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  31.21 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  30.6 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  31.41 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  26.8 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  30.6 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  31.45 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  51.06 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  27.15 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  32.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  30.87 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  30.87 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  44.68 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  27.7 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  28.85 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  29.87 
 
 		 146 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  31.34 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  31.34 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  46.67 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  46.67 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  31.21 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  28.29 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  28.12 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.59 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  31.54 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>