More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  68.24 
 
 		 503 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  64.69 
 
 		 565 aa  650    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  67.19 
 
 		 512 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 		 504 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  75.46 
 
 		 495 aa  759    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  66.33 
 
 		 507 aa  653    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 		 500 aa  720    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  71.14 
 
 		 503 aa  701    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  64.89 
 
 		 502 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  81.67 
 
 		 515 aa  808    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 512 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  67 
 
 		 501 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  100 
 
 		 510 aa  1035    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 528 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 		 505 aa  659    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 512 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  64.89 
 
 		 502 aa  663    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  67 
 
 		 509 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  77.96 
 
 		 504 aa  820    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  70.41 
 
 		 502 aa  728    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 		 501 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 560 aa  617  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  62.4 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 496 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 499 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  60.9 
 
 		 500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 499 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 500 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 506 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 520 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 501 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 1113 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 1100 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 1094 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 1138 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  49.19 
 
 		 1098 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 1101 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 1112 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 1120 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 1112 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 1100 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 1111 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.82 
 
 		 1147 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 1172 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 511 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 583 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 510 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 563 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 647 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.48 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 491 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 1118 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 514 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 508 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 508 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 567 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>