More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4711 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 500 aa  666    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  95.82 
 
 		 502 aa  972    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 		 512 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 		 503 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 		 496 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  70.72 
 
 		 504 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 512 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 501 aa  704    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1005    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 		 528 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  64.89 
 
 		 510 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 512 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 509 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 		 504 aa  649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  63.62 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 500 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 499 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 515 aa  624  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 500 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 507 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  65.11 
 
 		 501 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 		 495 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  63.13 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 506 aa  614  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 		 499 aa  609  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 503 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  57.91 
 
 		 565 aa  568  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 		 1113 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 501 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 560 aa  553  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 504 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 1100 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  53.89 
 
 		 1098 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 1094 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 1138 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 1101 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 1111 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 1112 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 1112 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 1120 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.89 
 
 		 1147 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 1100 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 1172 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.85 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 562 aa  405  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 510 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 1118 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 647 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 563 aa  398  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.15 
 
 		 771 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 492 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 1132 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 502 aa  382  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 510 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>