More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4987 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1015    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  80.61 
 
 		 496 aa  832    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 		 506 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  74.9 
 
 		 499 aa  778    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 		 499 aa  726    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  69.54 
 
 		 499 aa  728    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  70 
 
 		 500 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 502 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 502 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 528 aa  623  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 		 1113 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 503 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 1100 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 504 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 501 aa  596  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 503 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 1094 aa  571  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 512 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 504 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  58.5 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  56.76 
 
 		 1098 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 500 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 505 aa  555  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  56.94 
 
 		 502 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 507 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 495 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 516 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  54.67 
 
 		 1147 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  54.71 
 
 		 565 aa  528  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 1138 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 1101 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 1112 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 1112 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 1100 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 1111 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 1172 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 1120 aa  492  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 560 aa  491  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 1118 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 1132 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 494 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 562 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 647 aa  428  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 583 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 499 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.7 
 
 		 771 aa  424  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 573 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.74 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 509 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 499 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>