More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2881 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  76.64 
 
 		 499 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  67.21 
 
 		 502 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 496 aa  1005    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  66.8 
 
 		 506 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 		 502 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  67.62 
 
 		 528 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  78.07 
 
 		 499 aa  799    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  76.23 
 
 		 500 aa  775    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  80.61 
 
 		 500 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  75.2 
 
 		 499 aa  756    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  63.97 
 
 		 1113 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 501 aa  633  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 504 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  65.17 
 
 		 503 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 1100 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 501 aa  588  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 503 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  60.45 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  58.97 
 
 		 1098 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 1094 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  59.27 
 
 		 502 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 509 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 500 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 495 aa  557  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 515 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 1138 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 507 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 516 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 1112 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 1101 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 1112 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 1111 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  54.41 
 
 		 565 aa  522  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 504 aa  525  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 1100 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.74 
 
 		 1147 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 1172 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 1120 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 1118 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 583 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 562 aa  445  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 499 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 499 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 647 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 563 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 489 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.21 
 
 		 771 aa  430  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 502 aa  428  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 502 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 496 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 533 aa  419  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.62 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 1132 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 501 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 567 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 503 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>