More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2998 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 1138 aa  1230    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 1120 aa  801    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 1113 aa  860    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1111 aa  2243    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  74.67 
 
 		 1172 aa  1647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  98.92 
 
 		 1112 aa  2153    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 1094 aa  923    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  82.75 
 
 		 1101 aa  1785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.25 
 
 		 1147 aa  797    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 1100 aa  1019    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  98.92 
 
 		 1112 aa  2153    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  83.36 
 
 		 1100 aa  1797    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  51.03 
 
 		 1098 aa  1017    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 		 506 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 500 aa  509  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 499 aa  485  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 500 aa  486  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 501 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 528 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 502 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.43 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.57 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 504 aa  426  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 500 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 512 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 507 aa  416  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 501 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 503 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  43.55 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 501 aa  403  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 573 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 510 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 512 aa  393  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 520 aa  392  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  41.57 
 
 		 592 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 560 aa  388  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 1118 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 491 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 561 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 512 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 504 aa  369  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  48.95 
 
 		 578 aa  369  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 489 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 1132 aa  365  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 502 aa  365  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 505 aa  365  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 512 aa  364  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 488 aa  364  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  40.86 
 
 		 505 aa  364  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  40.86 
 
 		 505 aa  364  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 505 aa  363  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 505 aa  363  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 505 aa  363  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 505 aa  363  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 505 aa  363  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 503 aa  363  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 497 aa  362  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 499 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 493 aa  362  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  40.95 
 
 		 496 aa  362  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 495 aa  361  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 501 aa  361  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 508 aa  360  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 512 aa  360  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 533 aa  360  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 496 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 505 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 501 aa  357  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 513 aa  357  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 501 aa  357  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  40.2 
 
 		 771 aa  356  1e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 502 aa  355  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 499 aa  356  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 489 aa  355  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 513 aa  356  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 561 aa  354  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 502 aa  354  5.9999999999999994e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 507 aa  353  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>