More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1032 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 501 aa  1022    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  59.88 
 
 		 524 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 508 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 		 491 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  58.47 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  58.63 
 
 		 491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 		 504 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 492 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 508 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 510 aa  571  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 513 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 492 aa  568  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 503 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 492 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 494 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 512 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 494 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 514 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 509 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 519 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 505 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0485  lysyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.481097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 		 511 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 505 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 505 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 505 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 505 aa  548  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2603  lysyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 513 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 505 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 505 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3250  lysyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.273416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  55.21 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 518 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 532 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  55.21 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 508 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 504 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0288  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 491 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  55.17 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1054  lysyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 506 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 520 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 506 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  53.86 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  54.97 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  53.86 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 503 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0841  lysyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 505 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1409  lysyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 502 aa  531  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>