More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13230 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 647 aa  640    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 533 aa  659    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  63.11 
 
 		 499 aa  648    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  100 
 
 		 771 aa  1606    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 489 aa  492  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 510 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 494 aa  488  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 491 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 1118 aa  485  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 495 aa  478  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 508 aa  476  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.61 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 502 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.69 
 
 		 491 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 573 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 573 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 491 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 489 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 508 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 497 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 494 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 504 aa  459  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 631 aa  458  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 1132 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 496 aa  459  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 492 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 499 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 499 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 499 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 499 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 494 aa  452  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 512 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 505 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 512 aa  446  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 511 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 508 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 532 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 512 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 508 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 489 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>