More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2234 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  65.1 
 
 
503 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 
502 aa  717    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  69.8 
 
 
532 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 
501 aa  698    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 
501 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
504 aa  1043    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
496 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 
491 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  57.38 
 
 
491 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
492 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 
503 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 
494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
489 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
484 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
488 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
489 aa  555  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
499 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
499 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
493 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
511 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
496 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
491 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
494 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
494 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
499 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
499 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 
499 aa  545  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  52.65 
 
 
505 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  52.65 
 
 
505 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
499 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
499 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
499 aa  545  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
499 aa  545  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 
499 aa  541  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
499 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
499 aa  545  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 
499 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
515 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
513 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
515 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  52.97 
 
 
505 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
505 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
505 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
505 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
505 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
505 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
505 aa  532  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
502 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  52.97 
 
 
505 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
505 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 
502 aa  532  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
505 aa  534  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  54.92 
 
 
496 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  54.92 
 
 
496 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
494 aa  530  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
505 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
498 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
505 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
496 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
505 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
505 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
505 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
498 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
505 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
505 aa  527  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
497 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
505 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
499 aa  527  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  53 
 
 
508 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
506 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 
495 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 
503 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
505 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
504 aa  522  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 
496 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
505 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 
496 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
506 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0048  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
495 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
500 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 
524 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
508 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
514 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
505 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
508 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 
505 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
508 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
508 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>