More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0175 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  70.64 
 
 		 499 aa  727    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 510 aa  1051    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 490 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  66.12 
 
 		 489 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  67.08 
 
 		 489 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 		 491 aa  680    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 		 488 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 		 493 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 489 aa  639    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 		 499 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 		 497 aa  628  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 503 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 494 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 499 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 499 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 499 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 499 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 499 aa  601  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 499 aa  601  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 499 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 494 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 631 aa  592  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 499 aa  591  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 501 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 501 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 		 495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 495 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 561 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 492 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 491 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  54.71 
 
 		 491 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 494 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 573 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 573 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 494 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 496 aa  558  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 573 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 494 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 497 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 492 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 492 aa  551  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 518 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 508 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 524 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 488 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 508 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 506 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 512 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 506 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 510 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 513 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 505 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  53.99 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  53.78 
 
 		 496 aa  532  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 505 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 647 aa  532  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 508 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>