More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0251 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 499 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 488 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  66.12 
 
 		 489 aa  670    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  63.66 
 
 		 490 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 489 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 499 aa  1025    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  70.64 
 
 		 510 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 491 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 493 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 		 489 aa  633  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 497 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 501 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 499 aa  594  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 499 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 499 aa  591  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 		 631 aa  591  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 495 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  56.12 
 
 		 491 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 502 aa  555  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 504 aa  558  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 494 aa  552  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 503 aa  554  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 573 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 573 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 507 aa  541  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 561 aa  539  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 532 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 512 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 497 aa  527  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 504 aa  528  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 524 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 492 aa  525  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 505 aa  521  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 496 aa  521  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 505 aa  521  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 506 aa  518  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 518 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 508 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 508 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 494 aa  518  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 503 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  50.69 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 506 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  50.69 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 511 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 508 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 514 aa  512  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 508 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>