More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2319 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1132 aa  2241    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 1118 aa  993    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.34 
 
 		 771 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 647 aa  458  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 504 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 499 aa  445  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 509 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 495 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 573 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 573 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 491 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 573 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 503 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 499 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.27 
 
 		 499 aa  433  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 513 aa  429  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 502 aa  429  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 508 aa  426  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 499 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  49.06 
 
 		 1098 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 494 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 493 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 508 aa  419  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 499 aa  416  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 499 aa  416  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 499 aa  416  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 499 aa  416  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 499 aa  416  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 489 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 494 aa  416  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.51 
 
 		 496 aa  415  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 499 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 499 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 510 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 515 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 507 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 515 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 488 aa  410  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 500 aa  409  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 492 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 496 aa  406  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 492 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 508 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 489 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 499 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 490 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 495 aa  399  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 496 aa  399  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 489 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 496 aa  399  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 509 aa  399  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 494 aa  399  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 496 aa  399  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 1113 aa  396  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  46.38 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 489 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 1100 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0836  lysyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 500 aa  393  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 502 aa  393  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 509 aa  393  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2270  lysyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 511 aa  393  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 514 aa  392  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>