More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3422 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  83.94 
 
 		 500 aa  872    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  76.64 
 
 		 496 aa  775    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  88.37 
 
 		 499 aa  883    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  65.12 
 
 		 1113 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  62.68 
 
 		 506 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 499 aa  1019    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  72.24 
 
 		 499 aa  729    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 		 500 aa  726    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 528 aa  621  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 		 502 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 		 502 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 1100 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 501 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  60.37 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 503 aa  571  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 1094 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 500 aa  548  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  56.8 
 
 		 502 aa  545  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 512 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 520 aa  541  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 516 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  55.85 
 
 		 1098 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 501 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 507 aa  531  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 1138 aa  508  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  52.76 
 
 		 565 aa  504  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 1120 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.93 
 
 		 1147 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 1101 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 1100 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 1112 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 1112 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 1111 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 1172 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 560 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 1118 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 510 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 489 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 494 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 489 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 647 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 494 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 503 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 563 aa  425  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.71 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 499 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 493 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 578 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 489 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 1132 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 499 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 499 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  44.27 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>