More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0720 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  66.4 
 
 		 502 aa  681    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  71.14 
 
 		 510 aa  697    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 503 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  69.51 
 
 		 495 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  71.17 
 
 		 504 aa  734    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 515 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 512 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 503 aa  1011    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 		 512 aa  641    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 512 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 		 500 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  65.74 
 
 		 504 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  64.14 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 507 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 		 528 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  62.09 
 
 		 565 aa  619  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 501 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  62.43 
 
 		 505 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 		 499 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 560 aa  594  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 499 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 510 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 516 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 501 aa  522  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 1113 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 1100 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 1094 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  50.1 
 
 		 1098 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 1120 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 1138 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.87 
 
 		 1147 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 1100 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 1111 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 1112 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 1101 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 1112 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 1172 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 1118 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 573 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.12 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 1132 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 491 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 515 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 647 aa  363  3e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 562 aa  363  3e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 509 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 489 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 511 aa  362  6e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 496 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 505 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 523 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 489 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 502 aa  360  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 503 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 504 aa  359  7e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 491 aa  359  8e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 494 aa  358  9e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  39.48 
 
 		 771 aa  356  5e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 501 aa  356  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>