More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24660 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 520 aa  1046    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  68.66 
 
 		 504 aa  683    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  68.02 
 
 		 512 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  68.08 
 
 		 510 aa  686    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 516 aa  684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 528 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 502 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 502 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  55.92 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 504 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 499 aa  541  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 499 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 504 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 495 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  53.46 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 500 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 509 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 507 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  48.88 
 
 		 565 aa  475  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 560 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 1113 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 1100 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 1120 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  47.37 
 
 		 1098 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 1101 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 1100 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 1094 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.99 
 
 		 771 aa  410  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 1138 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 1172 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 1111 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 1112 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 1112 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.46 
 
 		 1147 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 509 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 647 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.03 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 573 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 489 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 523 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 1118 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 495 aa  363  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 489 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 491 aa  363  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 573 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 489 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 497 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 499 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 499 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 496 aa  355  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>