More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
1113 aa  839    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
1094 aa  910    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
1172 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
1100 aa  842    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
1120 aa  929    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  50.35 
 
 
1098 aa  850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
1111 aa  781    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
1112 aa  780    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
1101 aa  818    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
1138 aa  811    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
1112 aa  780    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
1100 aa  829    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  100 
 
 
1147 aa  2259    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
500 aa  535  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 
506 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 
500 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
496 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
499 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
499 aa  499  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
501 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
528 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
503 aa  439  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
515 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
500 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.82 
 
 
510 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
504 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
495 aa  433  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
503 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
501 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  32.4 
 
 
917 aa  426  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
510 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
504 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.01 
 
 
502 aa  423  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  45.31 
 
 
565 aa  418  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
507 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
512 aa  416  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
560 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
512 aa  406  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
509 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
520 aa  399  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
516 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
1118 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
505 aa  386  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
501 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
502 aa  376  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
502 aa  376  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
1132 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
578 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
577 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.02 
 
 
771 aa  369  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
583 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
492 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
508 aa  369  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
509 aa  366  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
562 aa  365  3e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
512 aa  361  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
509 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
533 aa  358  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
512 aa  358  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
513 aa  357  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
503 aa  357  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
631 aa  357  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
496 aa  355  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
501 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
515 aa  355  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
502 aa  354  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
502 aa  354  5.9999999999999994e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
501 aa  354  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
523 aa  353  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
573 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
512 aa  353  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
501 aa  353  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
502 aa  353  1e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
573 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
499 aa  353  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
488 aa  353  1e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
504 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
494 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
498 aa  352  3e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
561 aa  352  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  40 
 
 
494 aa  352  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
573 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
511 aa  350  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
493 aa  351  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
484 aa  350  7e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
495 aa  350  9e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2366  lysyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
522 aa  350  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
509 aa  350  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
489 aa  349  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
573 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  39.39 
 
 
498 aa  349  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
502 aa  348  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>