More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2977 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 		 495 aa  739    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  63.15 
 
 		 565 aa  642    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 504 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  67.94 
 
 		 507 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 		 502 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 		 502 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1024    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 505 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 501 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  74.7 
 
 		 515 aa  744    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  71.17 
 
 		 503 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  77.96 
 
 		 510 aa  795    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 		 512 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 		 512 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 		 500 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  73.49 
 
 		 502 aa  762    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 		 512 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 509 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 503 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 501 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 		 560 aa  611  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 528 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 499 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 499 aa  557  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 500 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 506 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 512 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 504 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 501 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 1113 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 1100 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 1094 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 1100 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  48.16 
 
 		 1098 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 1138 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 1101 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 1112 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 1120 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 1111 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 1112 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.57 
 
 		 1147 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 1172 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 561 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 573 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.29 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 510 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 573 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  43.91 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 499 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 512 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 508 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 499 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 508 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 491 aa  362  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 505 aa  362  9e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 499 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 532 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 502 aa  362  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 511 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 506 aa  360  2e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 502 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 490 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 505 aa  360  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 524 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 501 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>