More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0637 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 503 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  67.41 
 
 		 502 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 		 504 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  67.62 
 
 		 496 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 528 aa  1061    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 		 502 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 501 aa  633  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  63.91 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 499 aa  621  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  63.87 
 
 		 507 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 500 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 500 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 499 aa  621  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 		 500 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 		 512 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 		 501 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 		 503 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 		 512 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 512 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  62.55 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 506 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 504 aa  596  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 505 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 501 aa  581  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 495 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 520 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 512 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 516 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  56.15 
 
 		 565 aa  552  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 1113 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 504 aa  549  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 560 aa  540  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 1100 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  56.47 
 
 		 1098 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 1094 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.81 
 
 		 1147 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 1138 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 1112 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 1112 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 1120 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 1111 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 1101 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 1100 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 1172 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.84 
 
 		 499 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 489 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 1118 aa  399  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 647 aa  399  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 495 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 499 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 499 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.53 
 
 		 771 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 573 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 508 aa  385  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 583 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 499 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 1132 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 496 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 573 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 562 aa  376  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>