More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1777 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
560 aa  1150    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  84.56 
 
 
565 aa  960    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 
500 aa  633  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 
504 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
503 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  60.81 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 
515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 
507 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  59.72 
 
 
502 aa  590  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  59.24 
 
 
495 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 
503 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 
509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
512 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
512 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
512 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 
501 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
502 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
501 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
528 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
504 aa  537  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
505 aa  538  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
516 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
500 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
496 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
499 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
506 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
499 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
1113 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
501 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
1094 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  45 
 
 
1098 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
1120 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.47 
 
 
1147 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
511 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
515 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
1100 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 
1101 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
509 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
583 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
1112 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
1111 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
1112 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
1100 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
507 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
501 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
1138 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
511 aa  382  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
514 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
508 aa  373  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
573 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
492 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
504 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
573 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  40.69 
 
 
499 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
514 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
515 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
577 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
505 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
1118 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
1172 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
523 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  40.94 
 
 
771 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
561 aa  363  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
573 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
509 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
493 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  42.68 
 
 
485 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
509 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
578 aa  357  5e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
503 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
505 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
497 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
501 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
496 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
513 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
502 aa  352  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
507 aa  352  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
512 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
512 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
501 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
499 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  40.61 
 
 
491 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
508 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
505 aa  350  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
491 aa  349  6e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
532 aa  349  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
513 aa  349  8e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
501 aa  349  9e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>