More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0855 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1016    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  69.58 
 
 		 510 aa  688    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  65.74 
 
 		 503 aa  650    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 504 aa  647    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 515 aa  635    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  70.52 
 
 		 502 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  70.72 
 
 		 502 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 512 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  66.87 
 
 		 512 aa  661    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 501 aa  661    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 		 500 aa  655    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 		 528 aa  662    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 		 512 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 509 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 503 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 		 495 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 496 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  66 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  62.9 
 
 		 502 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  64.3 
 
 		 507 aa  617  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 499 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  61.29 
 
 		 500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  60.32 
 
 		 500 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 499 aa  588  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 512 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 506 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  57.03 
 
 		 565 aa  558  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 501 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 560 aa  537  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 1100 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 520 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 1113 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 1094 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  50.2 
 
 		 1098 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 1138 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 1101 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 1120 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 1112 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 1111 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 1112 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.27 
 
 		 1147 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 1100 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 510 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 647 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 1172 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 583 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.24 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 562 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 1118 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 563 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 567 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 503 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 573 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 502 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 506 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 573 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>