More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1919 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
567 aa  1175    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  68.39 
 
 
578 aa  711    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 
504 aa  680    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  75.44 
 
 
563 aa  900    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  75.18 
 
 
562 aa  886    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 
573 aa  655    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
583 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4009  lysyl-tRNA synthetase  62.62 
 
 
571 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 
502 aa  638    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0741  lysyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 
575 aa  634  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 
507 aa  559  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
511 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
511 aa  553  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
509 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
515 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
514 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
499 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
491 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
494 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
493 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
489 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
501 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
501 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
499 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
494 aa  485  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
499 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
499 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
510 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
499 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
499 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
499 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
497 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
499 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
499 aa  475  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  48.8 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  48.8 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
507 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
488 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
631 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
495 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
561 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
494 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
491 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
515 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  47.42 
 
 
491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
573 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
515 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
505 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
573 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
505 aa  452  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
505 aa  450  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
494 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
505 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
489 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
503 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
647 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
505 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
492 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  47 
 
 
505 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
497 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
573 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
577 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
492 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
495 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>