More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0127 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 1113 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 1120 aa  851    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.33 
 
 		 1147 aa  823    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 1101 aa  1243    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1138 aa  2302    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 1094 aa  946    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 1112 aa  1226    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 1172 aa  1188    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  48.6 
 
 		 1098 aa  949    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 1112 aa  1226    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 1100 aa  1232    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 1111 aa  1225    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 1100 aa  978    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 506 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 496 aa  546  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 499 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 528 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 501 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 502 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 502 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.41 
 
 		 510 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 504 aa  446  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 515 aa  446  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 495 aa  446  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.98 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 500 aa  425  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 512 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 512 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 501 aa  419  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 533 aa  417  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  44.62 
 
 		 565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 1118 aa  406  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 505 aa  405  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 510 aa  406  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 489 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 510 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 489 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 562 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 504 aa  395  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 501 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 512 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.68 
 
 		 771 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 504 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 507 aa  386  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 560 aa  385  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 561 aa  383  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 515 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 501 aa  383  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 501 aa  383  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 647 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 494 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 511 aa  379  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 490 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.53 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 499 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 512 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 489 aa  377  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 502 aa  376  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 512 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 503 aa  376  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  40.24 
 
 		 496 aa  375  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>