More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1737 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 1172 aa  804    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 1101 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.12 
 
 		 1147 aa  929    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 1094 aa  933    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 1112 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 1113 aa  884    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  46.92 
 
 		 1098 aa  868    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 1138 aa  844    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 1100 aa  852    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 1112 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 1100 aa  802    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1120 aa  2246    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 1111 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 506 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 496 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 499 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 500 aa  493  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 499 aa  489  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 499 aa  469  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 502 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 502 aa  446  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.45 
 
 		 510 aa  436  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 504 aa  436  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  45.92 
 
 		 565 aa  435  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 504 aa  435  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 515 aa  432  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 520 aa  429  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.73 
 
 		 502 aa  428  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 507 aa  429  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 504 aa  426  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 512 aa  416  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 560 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 509 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 505 aa  392  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 1118 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 562 aa  366  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  31.59 
 
 		 917 aa  364  6e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 492 aa  359  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 578 aa  357  7.999999999999999e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  39.69 
 
 		 592 aa  356  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 493 aa  354  5e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 496 aa  353  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 489 aa  353  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  39.96 
 
 		 771 aa  353  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 497 aa  352  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 573 aa  350  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 509 aa  349  1e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 501 aa  350  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 563 aa  349  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 499 aa  347  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 573 aa  347  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 501 aa  346  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 501 aa  346  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 502 aa  345  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 508 aa  345  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 495 aa  345  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 502 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 505 aa  345  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 499 aa  344  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 502 aa  343  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 504 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 533 aa  342  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 1132 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 508 aa  342  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 573 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 502 aa  341  4e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 501 aa  341  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 515 aa  341  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 515 aa  341  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 499 aa  341  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 573 aa  340  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 515 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 583 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 504 aa  338  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 509 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 491 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 494 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 489 aa  336  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 561 aa  335  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 502 aa  335  3e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 494 aa  334  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 647 aa  335  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 484 aa  335  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 567 aa  334  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 502 aa  334  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>