More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5144 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 
500 aa  679    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  66.46 
 
 
495 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  80.28 
 
 
505 aa  800    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 
515 aa  648    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  72.8 
 
 
507 aa  739    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  67.19 
 
 
510 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  62.85 
 
 
502 aa  635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  99.8 
 
 
512 aa  1033    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  66.87 
 
 
504 aa  661    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
512 aa  1034    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 
504 aa  660    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  67.94 
 
 
503 aa  695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  87.6 
 
 
501 aa  871    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  65.2 
 
 
502 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  99.8 
 
 
512 aa  1033    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  87.37 
 
 
509 aa  897    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 
502 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 
503 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 
501 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 
528 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  59.02 
 
 
565 aa  587  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 
496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
560 aa  567  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 
500 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 
499 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 
499 aa  549  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 
516 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
499 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
506 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
500 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
510 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
512 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 
504 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
1113 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
1094 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
1100 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  51.01 
 
 
1098 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
1100 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
1138 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
1101 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
1111 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
1112 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
1112 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
1120 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.67 
 
 
1147 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
489 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
510 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
1172 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
497 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
583 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
647 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
504 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
494 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
491 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.83 
 
 
499 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
573 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
511 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
1118 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
494 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
501 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
509 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
488 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
499 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
524 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
511 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
573 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
489 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
501 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
578 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
577 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
561 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
508 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
501 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
573 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
508 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
508 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
508 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
508 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
493 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
508 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
499 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
508 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
496 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
562 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
502 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.8 
 
 
771 aa  376  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
508 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
491 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
508 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
515 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
508 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
506 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
508 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
499 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
508 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
515 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
501 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
508 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>