More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0576 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  67.96 
 
 
503 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 
502 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
495 aa  670    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  71.02 
 
 
510 aa  707    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
500 aa  1003    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  69.01 
 
 
502 aa  704    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 
504 aa  723    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  68.21 
 
 
512 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
502 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 
504 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 
512 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  69.76 
 
 
507 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  66.87 
 
 
505 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 
515 aa  665    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  70.22 
 
 
501 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  68.21 
 
 
512 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  69.74 
 
 
509 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  66.47 
 
 
503 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 
560 aa  632  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  63.07 
 
 
565 aa  633  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 
501 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 
528 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 
496 aa  568  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 
516 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 
499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
500 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  58 
 
 
499 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 
512 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 
500 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
510 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 
499 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
520 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
506 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
504 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
1113 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
501 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
1100 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
1094 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  49.18 
 
 
1098 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
1120 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.41 
 
 
1147 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
1138 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
1101 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
1111 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
1112 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
1112 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
1100 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
647 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
491 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  44.44 
 
 
499 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
1172 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
501 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
573 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
573 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
489 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
501 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
510 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
514 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
499 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
505 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
510 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
514 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
516 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
1118 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
573 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
509 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
515 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
511 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
506 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
496 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
504 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
496 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
496 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  45 
 
 
577 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
583 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
504 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
494 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
505 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
514 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
506 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
500 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
494 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
499 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
497 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
511 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
562 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
499 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
499 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
515 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
503 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
561 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
509 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
499 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
523 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
499 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
494 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
519 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
502 aa  368  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
501 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
502 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>