More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0503 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  66.33 
 
 		 578 aa  722    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  66.2 
 
 		 562 aa  698    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 502 aa  680    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  66.73 
 
 		 583 aa  721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 573 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1040    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0741  lysyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 575 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 		 567 aa  680    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  65.34 
 
 		 563 aa  701    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4009  lysyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 571 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 523 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 501 aa  589  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 509 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  51.37 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 492 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 494 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  46.99 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 631 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  46.99 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  47.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 515 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 496 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 515 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 503 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>