More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0329 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  64.86 
 
 		 502 aa  653    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  67.94 
 
 		 512 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 503 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 528 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  68.89 
 
 		 501 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  71.02 
 
 		 502 aa  690    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 501 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  68.24 
 
 		 510 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 515 aa  672    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 		 505 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 503 aa  1014    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  67.67 
 
 		 507 aa  677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 		 512 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  67.76 
 
 		 504 aa  679    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  65.92 
 
 		 495 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  67.96 
 
 		 500 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 504 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 		 512 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 509 aa  688    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 		 502 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  65.17 
 
 		 496 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  62.01 
 
 		 565 aa  625  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 500 aa  608  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 		 560 aa  609  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  60.73 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 501 aa  527  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 504 aa  519  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 1113 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 1100 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  52.87 
 
 		 1098 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 1094 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 1138 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 1120 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 1112 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 1112 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 1111 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 1101 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 1100 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.08 
 
 		 1147 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 1172 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.46 
 
 		 499 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 647 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 491 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 562 aa  385  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 573 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 493 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 1118 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 508 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 509 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 501 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 1132 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.12 
 
 		 771 aa  375  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 523 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 573 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  40.74 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>