More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13631 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 		 503 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 502 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  79.8 
 
 		 501 aa  794    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  66.87 
 
 		 500 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  65.2 
 
 		 510 aa  660    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  80.48 
 
 		 512 aa  828    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  63.13 
 
 		 502 aa  634    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  69.7 
 
 		 507 aa  729    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  80.28 
 
 		 512 aa  827    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 505 aa  1022    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  80.48 
 
 		 512 aa  828    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  81.98 
 
 		 509 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 504 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 515 aa  628  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 		 504 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 495 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  60.96 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  62.43 
 
 		 503 aa  614  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 528 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 		 501 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  56.8 
 
 		 565 aa  568  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 499 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 560 aa  556  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 516 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 500 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 506 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 520 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 1113 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 1100 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  50.2 
 
 		 1098 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 1094 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 1101 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 1138 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 1112 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 1112 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 1111 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 1100 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 1120 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.05 
 
 		 1147 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 1172 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.69 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 647 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 489 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 583 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 510 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 562 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 578 aa  375  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  40.87 
 
 		 771 aa  372  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 631 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 573 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>