More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8377 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 499 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  64.26 
 
 		 500 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  62.68 
 
 		 499 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  66.8 
 
 		 496 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 		 499 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 		 500 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 506 aa  1028    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 502 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 528 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 1100 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 1113 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  56.62 
 
 		 1098 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 1094 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 1138 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 1101 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 		 1111 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 1112 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 1112 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  55.58 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 1100 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 495 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 1172 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  54.2 
 
 		 1147 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 1120 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 516 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.66 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 501 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  50.81 
 
 		 565 aa  486  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 560 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 493 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.62 
 
 		 771 aa  413  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 1118 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 508 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 578 aa  395  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 562 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.66 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 647 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 489 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 490 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 532 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>