More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0856 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  73.48 
 
 
509 aa  775    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 
513 aa  675    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  74.01 
 
 
561 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 
502 aa  683    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 
502 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 
512 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 
512 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  73.04 
 
 
504 aa  770    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  98.95 
 
 
573 aa  1161    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  64 
 
 
513 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
573 aa  1172    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 
488 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  81.5 
 
 
573 aa  981    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  66.53 
 
 
508 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  62.8 
 
 
503 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
512 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50879  predicted protein  57.06 
 
 
607 aa  593  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  59.8 
 
 
485 aa  587  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
510 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
491 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
495 aa  548  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
494 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
497 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
494 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
489 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
499 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
490 aa  544  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
489 aa  538  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
495 aa  534  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
493 aa  534  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
499 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
489 aa  531  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
515 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
515 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
499 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
499 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
499 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
499 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
523 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
488 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 
509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  52.53 
 
 
491 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
501 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
499 aa  511  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
491 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
499 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 
508 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
492 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
503 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
647 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 
494 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
494 aa  501  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
496 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
502 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 
503 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
502 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
497 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
496 aa  491  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
492 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
494 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
492 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
502 aa  490  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
505 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
489 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
1118 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
496 aa  487  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2240  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
503 aa  485  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102374  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
508 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
496 aa  482  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
510 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
508 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
508 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
508 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
508 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
508 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
532 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
508 aa  485  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
508 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.2 
 
 
499 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
489 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
631 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
495 aa  482  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
508 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
524 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 
501 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
504 aa  480  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
508 aa  481  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
501 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
505 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
505 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
505 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
505 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>