More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0641 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  73.29 
 
 		 515 aa  721    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  66.46 
 
 		 512 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 495 aa  1000    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  75.46 
 
 		 510 aa  740    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  69.51 
 
 		 503 aa  683    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  73.68 
 
 		 504 aa  739    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 512 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 		 500 aa  670    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  68.7 
 
 		 502 aa  678    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 512 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 509 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  65.92 
 
 		 503 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 		 504 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 501 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 		 502 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  64.5 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 505 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 507 aa  611  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  61.63 
 
 		 565 aa  599  1e-170  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 501 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  59.24 
 
 		 560 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 499 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 516 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 506 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 500 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 512 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 510 aa  525  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 520 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 1113 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 1100 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 1138 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 1094 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  49.29 
 
 		 1098 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 1101 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 1172 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 1112 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 1111 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 1112 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 1100 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.79 
 
 		 1147 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 1120 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 573 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.06 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 583 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 578 aa  363  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 488 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 515 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 1118 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 502 aa  360  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 647 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 502 aa  359  7e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 489 aa  358  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 514 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 514 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 499 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 532 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 492 aa  356  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 503 aa  356  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 502 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 563 aa  355  8.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>