More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0131 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 490 aa  994    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 510 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  68.12 
 
 		 489 aa  681    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  63.66 
 
 		 499 aa  653    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  61.35 
 
 		 493 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  59.92 
 
 		 489 aa  620  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 		 491 aa  614  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 489 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 494 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 494 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 499 aa  586  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 499 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 499 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 497 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 499 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 501 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 501 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 573 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 573 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 504 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 631 aa  532  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  54.62 
 
 		 491 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 573 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 491 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 497 aa  528  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 509 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 494 aa  527  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 561 aa  522  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 492 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 498 aa  518  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 505 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 494 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 503 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.07 
 
 		 498 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 503 aa  510  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 512 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 496 aa  501  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 502 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 503 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 501 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  51.12 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 502 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  51.12 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 501 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 532 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.51 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 496 aa  495  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  51.65 
 
 		 496 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  51.44 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>