More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1681 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
491 aa  987    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
489 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
497 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
489 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
491 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
510 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
499 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
494 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
501 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
501 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
499 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
499 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 
495 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
489 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
490 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
515 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
488 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
515 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
498 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.82 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
573 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
497 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
499 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
573 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
631 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  48.35 
 
 
491 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
504 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
489 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 
489 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
491 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
513 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
513 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
494 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
509 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
492 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
573 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
515 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
494 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
492 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
502 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
532 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
494 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
505 aa  442  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
508 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
512 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
488 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
561 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
512 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
523 aa  438  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
494 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
504 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
501 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
502 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
504 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
496 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
502 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
503 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
503 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
496 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
496 aa  431  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
502 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
502 aa  432  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2800  lysyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
498 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.366635  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47 
 
 
499 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.06 
 
 
496 aa  431  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
583 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
511 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
514 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
515 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
512 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
509 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
501 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
502 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
501 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
577 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
503 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
509 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
506 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
514 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>