More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_517 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  95.38 
 
 
498 aa  959    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  93.57 
 
 
498 aa  974    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  100 
 
 
498 aa  1028    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
489 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
489 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
494 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
499 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
494 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
499 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 
499 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
488 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 
490 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
495 aa  508  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
515 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
510 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
515 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
495 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
496 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
499 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
489 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
561 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
489 aa  495  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
493 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
497 aa  491  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
497 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
491 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.27 
 
 
491 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
499 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
496 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
496 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
494 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
489 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
492 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
492 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
492 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
491 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
508 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  49.29 
 
 
505 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
505 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
505 aa  471  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
505 aa  471  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  49.29 
 
 
505 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
523 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
502 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
509 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
505 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
494 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
573 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 
504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  48.18 
 
 
505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  48.18 
 
 
505 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
499 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
502 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
631 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 
504 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
495 aa  466  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
512 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
508 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
512 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
494 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
488 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
573 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
573 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3718  lysyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
498 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.448717  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
494 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
509 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>