More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0078 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  93.46 
 
 		 489 aa  941    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  70.29 
 
 		 496 aa  716    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 489 aa  993    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 492 aa  604  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 497 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 488 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 489 aa  511  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 491 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 510 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.53 
 
 		 498 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 523 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 497 aa  488  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 494 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 499 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 499 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 495 aa  485  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 573 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 503 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 490 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 573 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 631 aa  479  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 508 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 573 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 507 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.8 
 
 		 491 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 501 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 501 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 499 aa  465  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 508 aa  465  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  48.28 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 491 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  48.28 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>