More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1378 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  76.86 
 
 		 509 aa  785    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 		 502 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  66.12 
 
 		 502 aa  689    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1015    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 502 aa  689    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 510 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 494 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 493 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 494 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 491 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 499 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 499 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 499 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 495 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 499 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 501 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 501 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 573 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 573 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 492 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.19 
 
 		 491 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 490 aa  481  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 512 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 496 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 508 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 488 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 573 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 492 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  47.1 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  47.23 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  47.23 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  47.1 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 501 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 503 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 507 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 494 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.13 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 504 aa  463  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>