More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0117 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 489 aa  1008    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 		 491 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 510 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 489 aa  628  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  59.92 
 
 		 490 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 		 494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 493 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 497 aa  599  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 495 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 501 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 495 aa  558  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 509 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 573 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 573 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 561 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 504 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 573 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 494 aa  527  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 496 aa  521  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 509 aa  511  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 502 aa  502  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 508 aa  501  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 502 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 496 aa  501  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 508 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 647 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 495 aa  495  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1117  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.462738  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.59 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1137  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1078  lysyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1206  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  47.95 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  52.81 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 498 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.18 
 
 		 498 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 499 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 532 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0836  lysyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  51.21 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>