More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0009 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  93.46 
 
 		 489 aa  941    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 489 aa  989    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  70.9 
 
 		 496 aa  717    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 		 492 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 488 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 497 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 489 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 491 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 489 aa  508  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 493 aa  508  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.74 
 
 		 498 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 573 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 494 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 499 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 498 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 490 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 508 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 499 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 499 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  471  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 495 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50 
 
 		 491 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 501 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 499 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 502 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 502 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 502 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 496 aa  455  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 532 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 511 aa  458  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 502 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  48.07 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 499 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0576  lysyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0138803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>