More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00750 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 
489 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  64.68 
 
 
499 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
491 aa  1003    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 
510 aa  680    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 
499 aa  671    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 
497 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  65.5 
 
 
489 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 
489 aa  647    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 
493 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 
499 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 
488 aa  628  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 
494 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
490 aa  614  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  60.42 
 
 
501 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  60.21 
 
 
501 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  60 
 
 
499 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
499 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
499 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 
494 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 
499 aa  608  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
631 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 
515 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 
515 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
495 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
503 aa  592  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
494 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  55.8 
 
 
491 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
508 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 
491 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 
511 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
496 aa  560  1e-158  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
573 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
505 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
504 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 
492 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
573 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
509 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  54.56 
 
 
505 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
505 aa  547  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
505 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  60.05 
 
 
505 aa  545  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
561 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  54.56 
 
 
505 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
504 aa  547  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
505 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
505 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
573 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
503 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
505 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
505 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 
496 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
492 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
492 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
507 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
506 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
499 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
502 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 
502 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.21 
 
 
499 aa  537  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 
497 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
647 aa  536  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
494 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
506 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
499 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
504 aa  536  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
496 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
501 aa  537  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
503 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
510 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
505 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
505 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 
501 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
505 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
505 aa  531  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 
513 aa  528  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
532 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
502 aa  528  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
505 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 
505 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
515 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
505 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
501 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
505 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 
508 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
502 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
518 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
508 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
509 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
513 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
508 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
508 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>