More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2238 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  74.23 
 
 		 499 aa  769    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 631 aa  677    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 647 aa  1326    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  62.7 
 
 		 771 aa  641    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 533 aa  584  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 491 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 494 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 494 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 494 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 573 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 495 aa  512  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 516 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 508 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 524 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 514 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 492 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 493 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 492 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 496 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 499 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  53.12 
 
 		 491 aa  505  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 499 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 515 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 508 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 508 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 573 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 508 aa  504  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 508 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 499 aa  502  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 508 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 497 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 489 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 508 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0485  lysyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.481097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 495 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 508 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 518 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 489 aa  495  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 508 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 508 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 505 aa  495  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 508 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 501 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 508 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 508 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 503 aa  492  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2603  lysyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 515 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3250  lysyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 508 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 513 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 519 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 495 aa  487  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>