More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2092 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  65.49 
 
 		 507 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 502 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 515 aa  1050    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 503 aa  693    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  68.96 
 
 		 502 aa  700    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  74.7 
 
 		 504 aa  768    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 502 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 504 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 512 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 		 503 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 		 500 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  81.67 
 
 		 510 aa  807    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  73.29 
 
 		 495 aa  741    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 512 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  64.09 
 
 		 509 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 512 aa  664    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  62.1 
 
 		 565 aa  632  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 505 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 501 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 560 aa  611  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 528 aa  594  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 499 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 500 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 500 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 499 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 520 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 504 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 501 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 1113 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 1100 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 1094 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 1138 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  48.71 
 
 		 1098 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 1120 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 1100 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 1112 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 1112 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.2 
 
 		 1147 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 1111 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 1101 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 509 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 1172 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 505 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  41.19 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.99 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  41.19 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 504 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>