More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1906 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1906  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
498 aa  973    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
491 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
499 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
510 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
501 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
501 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 
489 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
499 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
493 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
509 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
489 aa  435  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
523 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 
1118 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
499 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  51.45 
 
 
502 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
502 aa  431  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
577 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
494 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 
504 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
573 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
506 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
497 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
573 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
506 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
505 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
488 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
501 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
507 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.61 
 
 
771 aa  425  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
503 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
509 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
511 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
647 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
496 aa  420  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
561 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
495 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
503 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
501 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.22 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 
573 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  48.86 
 
 
505 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
513 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
505 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
505 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
504 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
507 aa  415  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
505 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
505 aa  415  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
505 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
502 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
511 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
496 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  48.86 
 
 
505 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
561 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
583 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 
496 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
505 aa  415  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 
508 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
505 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
490 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
502 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
494 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
631 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
494 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 
501 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
562 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
502 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
515 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
508 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
499 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
508 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
508 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
504 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
563 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
484 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.18 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
503 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
510 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
508 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  46.79 
 
 
496 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
494 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
508 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
502 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
514 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
501 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>