More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2028 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  67.65 
 
 		 513 aa  714    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  79.77 
 
 		 514 aa  859    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  82.94 
 
 		 510 aa  886    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5248  lysyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 519 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  97.83 
 
 		 508 aa  1027    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  91.14 
 
 		 508 aa  965    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  67.33 
 
 		 501 aa  709    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  95.08 
 
 		 508 aa  1004    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  82.17 
 
 		 516 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  66.07 
 
 		 501 aa  694    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2723  lysyl-tRNA synthetase  90.94 
 
 		 508 aa  962    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0288  lysyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 514 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  97.83 
 
 		 524 aa  1026    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  79.57 
 
 		 514 aa  858    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  85.91 
 
 		 518 aa  930    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2603  lysyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 515 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  91.14 
 
 		 508 aa  965    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 507 aa  655    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2591  lysyl-tRNA synthetase  90.94 
 
 		 508 aa  964    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  91.14 
 
 		 508 aa  970    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2645  lysyl-tRNA synthetase  91.14 
 
 		 508 aa  965    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.929733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1784  lysyl-tRNA synthetase  61.05 
 
 		 520 aa  650    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  75.1 
 
 		 509 aa  763    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3620  lysyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 		 516 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  87.52 
 
 		 513 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  81.75 
 
 		 515 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  97.83 
 
 		 508 aa  1027    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  91.14 
 
 		 508 aa  965    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  86.91 
 
 		 512 aa  931    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  91.14 
 
 		 508 aa  965    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1410  lysyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 		 520 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 508 aa  1046    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 514 aa  789    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 508 aa  648    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  97.83 
 
 		 508 aa  1027    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0485  lysyl-tRNA synthetase  73.1 
 
 		 514 aa  781    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.481097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 508 aa  1046    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3250  lysyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 515 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 518 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3050  lysyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 521 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 511 aa  633  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3052  lysyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 		 527 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 504 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  59 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  59 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 505 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 496 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 499 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 506 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 		 506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  57.51 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  57.51 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 505 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 505 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 505 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 505 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 505 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 505 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 500 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 496 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2997  lysyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 502 aa  591  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0048  lysyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 495 aa  588  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 499 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 500 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  57.76 
 
 		 502 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 501 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 509 aa  581  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>