More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1286 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 508 aa  1049    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 489 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 488 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 494 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 493 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  52.83 
 
 		 505 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  52.83 
 
 		 505 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 495 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  51.69 
 
 		 491 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 492 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 499 aa  497  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 505 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 499 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 499 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 499 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 505 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 496 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 494 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 499 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 532 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 499 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 501 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.9 
 
 		 498 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 523 aa  478  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1137  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1206  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 502 aa  475  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>